1) Opvragen van PDB-coördinaten :
Opsturen van een mail :
To: SMTP@SYS[retrieve@ncbi.nlm.nih.gov]
Cc:
Bcc:
From:
Subject:
Date: Friday, March 11, 1994 at 11:16:55 am
Attach:
Certify: N
Forwarded by:
De boodschap moet ten minste de volgende inhoud hebben :
DATALIB PDB
BEGIN
referentie naar gewenste eiwit (accesion number, naam ...)
Op vrij korte tijd wordt meestal een antwoord bekomen.
2) Omzetten van het antwoord naar een ASCII-file
Na het lezen van het document : druk F10
Kies uit het menu dat verschijnt : File
Geef een naam aan de nieuw te creëren file (XXXXXXXX.DOC), eventueel met de nodige verwijzingen naar de gewenste subdirectory.
3) Corrigeren van de toegestuurde file met behulp van WORD
Lees het document in WORD in.
Verwijder alle informatie die boven de coördinaten van de verschillende atomen staan (Alles boven 'ATOM 1 N ...') en na 'END' op het einde van de reeks coördinaten.
Verwijder de spaties die voor 'ATOM' staan :
doe dit met het comando
Replace
text: ^p^wATOM
with text: ^pATOM
Bewaar de file als WORD-file.
4) Converteren van PC naar Mac
Laad het PC-WORD bestand over op een DOS-schijfje.
Converteer dit bestand met behulp van het programma "Apple bestandsuitwisseling" (op Mac) naar een Mac-WORD bestand.
Dit bestand kan door Nanovision ingelezen worden voor het opmaken van 3D-figuren.